เมื่อเกิดปัญหาฟันผุสิ่งแรกที่เรานึกถึงคือต้องไปอุดฟัน แต่คนไข้หลายคนสงสัยว่าทำไมในกรณีของตนเองไม่สามารถใช้การอุดฟันใรการรักษาฟันผุได้ ซึ่งฟันผุที่ไม่สามารถอุดฟันได้เนื่องจาก คนไข้มีฟันผุมาเป็นระยะเวลาที่นานและลึกมากจนทะลุโพรงประสาทฟันจนไม่สามารถอุดฟันได้ เพราะเชื้อโรคเข้าไปในโพรงประสาทฟันทำให้เกิดการติดเชื้อ จึงจำเป็นต้องรักษารากฟันเพื่อเก็บฟันซี่นั้นไว้ ซึ่งหากไม่ทำการรักษารากฟันอาจทำให้เกิดการลุกลามไปยังฟันซี่อื่นได้
การรักษารากฟันนั้นทำโดยทันตแพทย์จะฉีดยาชา และเอาฟันผุหรือเนื้อฟันที่อักเสบออก หลังจากนั้นจะทำความสะอาดรากฟัน ใส่ยาลงไปในครอบรากฟัน ใช้เวลารักษาประมาณ 2-3 ครั้ง จากกนั้นจะทำการอุดปิด เพื่อป้องกันการติดเชื้อซ้ำในบางเคสหลังจากรักษารากฟัน อาจต้องทำเดือยทำครอบเพราะเป็นฟันผุขนาดใหญ่เนื้อฟันเหลือน้อย เพื่อป้องกันการแตก หลังจากรักษารากฟัน
จะเห็นการรักษารากฟันนั้นค่อนข้างยุ่งยากกว่าการอุดฟัน และมีค่าใช้จ่ายที่สูงกว่ามาก ดังนั้นคนไข้ควรมีตรวจฟันเป็นประจำเพื่อตรวจสภาพช่องปาก หากพบว่ามีปัญหาฟันผุ จะได้สามารถรักษาได้ตั้งแต่เนิ่นๆ และไม่เสียค่าใช้จ่ายสูง